当凯潜行到指挥甲板时，上面的战斗已经结束。一共五十名武装分子进攻了指挥甲板上的众人，大量的幸存者战死，只留下了西蒙、本杰明一家以及其他两名无关紧要的人。顺便说一句，在战斗开始之后，那名身份神秘的崔林小姐就消失不见了。
在此期间，萨吉带着山羊、小鬼、波特曼进行了坚决反击，他们试图和这帮武装分子沟通，他们主动表达了自己的身份――美军特殊反应部队，隶属于特种司令部。
可是没用，这帮武装分子根本不和他们进行沟通，就是一个劲的发动攻击。他们身上没有任何可供辨识的标志，萨吉也闹不清这些人到底隶属于哪个国家或者团体，但按照这些人的技战术风格，萨吉还是更倾向于这些人都是美国军人。
萨吉带着小队成员不断的反击，因为指挥甲板的特殊地形，开始萨吉带领小队还能通过仅有的机构通道来扼制那些武装分子的进攻，但久守必失，他们只有四个人，还需要兼顾那些幸存者，自然会给那些武装分子机会。
于是在僵持了差不多三十分钟后，那群武装分子还是攻入了指挥甲板。
这期间，幸存者损失惨重，山羊和小鬼也身受重伤，不仅如此，他们还和凯失去了联系，于是不得已之下，萨吉只能选择投降。
在武装人员占领指挥甲板之后，他们并未对剩下的人大开杀戒。他们只是将他们丢到一边看管起来，然后自顾自的开始对金库暴力拆解，他们的目标似乎是金库中的某样东西。
接着就是罗斯将军在一队士兵的保护下出现在所有人的面前。
看到罗斯将军身上的美军迷彩军装和中将军衔，萨吉等人立刻暴怒。这些人就是美军！罗斯这家伙在美军内部还是有点名气的，至少萨吉就认识这家伙。可他们明明表示了自己的身份，这些美军同僚却没有丝毫手软！
这破坏了美军之间的规矩！
军人之间虽然也讲究派系差别，但美军之间的争斗还从来没发展到，两只美军在明知道对方身份的情况下依然下死手的地步！
萨吉的不忿立刻引来了毫不留情的镇压，那些武装分子用枪柄狠狠的收拾了萨吉一顿。罗斯也只是看了看他们，没有做出任何回应。他当然知道自己这么做不妥。在明知道对方是特殊反应部队的情况下，还发动攻击，这件事的确很严重，要是一个不好罗斯回到美国就要上军事法庭。
毕竟特种司令部本身也是美军之中的一大山头，一旦得罪这种大山头，哪怕是罗斯这样的背景人士也吃不了兜着走。可问题是这艘船上的东西实在太重要了。重要到罗斯根本不需要顾忌一些东西。
而且再说了，在这种敏感时期，一支特殊反应部队的特战小队出现在船上，很难不让罗斯多想。这意味着这支特战小队非常有可能和血清被夺一事有关。所以从某种意义上，罗斯把他们归类为竞争者，一点毛病都没有。
这两者相加之下，就算事后特种司令部追责，他所在的派系也会帮他摆平。超级士兵血清的重要性对军方来说不言而喻，那些高层大佬会非常愿意帮罗斯来搞定那些杂音。相反要是血清除了问题，他罗斯哪怕没错，也是大错。