年，越南战争进入尾声，帝王组织的科学家通过卫星，发现了位于南太平洋骷髅岛的准确位置。
自年爱因斯坦的相对论引导着人类发展原子，原子时代的黎明就开始了。
然而人类不知道的是，这一技术的发展，也标志着某些古代生物将被原子能唤醒。
自从帝国大厦金刚事件之后，根据帝王组织的调查，这个世界陆续有怪兽活跃的迹象。
年，舰船劳顿号被巨大不明生物袭击沉没。
年，浓雾笼罩伦敦，帝王组织认为那是巨大神秘生物的翅膀扇动云雾造成的空气污染。
年，帝王组织开始全球化。
与此同时，原子弹时代开始了。
最初的原子弹爆炸谎称是核试验，其实是对哥斯拉进行抹杀的作战，可惜以失败告终。
哥斯拉沉入海底沉睡。
然而这些怪兽只有极少部分人见到，并没有什么实质性的证据，加上长久的战争，帝王组织因为经费原因，已经陷入了财政危机。
为了向世人证实怪兽真实存在，也为了帝王组织不至于破产，帝王组织必须尽快拿出铁证，因此“骷髅岛”再次被提上了台面。
帝王组织成员比尔兰达教授与布鲁克斯出面，说服了国务会，拿到了经费。
当然，他们的理由是卫星发现了一个小岛。
此时米国与苏联正处在冷战时期，双方都蹩这劲儿，为了不让苏联的人抢先，国务院允许了这个登岛计划。
不管岛上有什么，哪怕是坨屎，米国也要抢在苏联前面，吃最新鲜的。
比尔兰达教授与布鲁克斯获得国务院支持，有了经费，就开始部署他们的计划。
首先就是招募人手，其中就包括了英国空军特别部队前探员詹姆斯・康拉德。
詹姆斯・康拉德是一名追踪专家，曾经参与过数次重要战役，有着丰富的野外生存经验。
一名独立勇敢的反战记者韦弗。
华裔生物学家珊。
以及一批招募的学者，和刚刚从越战撤回的米国小队。
一行人乘坐航空母舰出发，经过长途跋涉，准备千里送人头，呃，是科学考察。
在航空母舰靠近骷髅岛后，因为骷髅岛外围的风暴，以及众多暗礁，航空母舰无法继续前进。
兰达教授与帕卡德上校等人坐上武装直升机出发，有惊无险的穿过了风暴层。
穿过暴风地带后，眼前豁然开朗，武装直升机小队来到了宛如世外桃源的骷髅岛上空。
碧绿的海水环绕着群山，一大片一大片的原始丛林展现在人们面前。